喀什兵团农三师医院位于新疆喀什市文化路280号，与农三师同年成立，四十年来，三师医院人发扬艰苦创业、开拓奋进的兵团精神，医院发展成为医疗、教学、科研为一体的综合性二级甲等医院。
喀什兵团农三师医院现有的医疗用房建筑面积21000余平方米，设置科室22个，核定床位250张，开放床位340张，职工326人(含合同制工人)，其中医疗卫生技术人员237人，高级职称36人，中级职称123人，百万元以上设备8台，十万元以上设备6台，十万元以上设备50余台，固定资产近五千万元，年平均住院9000人次，门诊量6.5万余人次，手术3000余台。在51团、伽师总场建立了两个分院。
近三年来，喀什兵团农三师医院的医疗技术水平有了长足的发展。内科在心血管、内分泌、消化、神经等专业中的很多项目以及普外、妇产科的技术水平日趋提升，手术疑难程度不断增加，一系列的腹腔镜手术的开展，使病人的创伤减小，住院时间缩短，由此减轻了病人的负担。其中外一科在肝、胆、结石、肝肿瘤、胃肠肿瘤、食管肿瘤等难度较大的手术方面有了很大的突破；骨科在脊柱手术、人工全膝、全髋关节置换术、记忆合金骨折固定术、带锁髓内钉及腰推间盘突出切吸术、
颈椎间盘切吸术等方面的技术日渐成熟；消化内科开展了胃镜诊断早期胃癌、食道及胃息肉胃镜下切除术、食道支架置入术、胆道逆行性造影、十二指肠乳头括约肌切开胆总管取石术等手术，使诊断治疗有了质的飞跃；妇产科相继开展了新式剖官产、阴式子官切除术、无痛分娩、无痛人流等多项新技术。耳鼻喉科已能独立开展鼻窦镜手术和鼾症手术。
喀什兵团农三师医院现有美国GE-螺旋CT、柯达CR机、日本岛津C型臂、柯达成像设备、潘太克斯电子胃镜、彩色多普勒心腹两用B超、前节激光治疗仪、电生理仪、7060大生化分析仪、电化学免疫发光系统、全自动五分类血细胞计数仪、奥林巴斯电子肠镜等设备。仅2004年—2005年，投入就达680多万元，购置了B超、CR机、改造了微机管理系统等。
实现了医疗设备固定资产增加值1100余万元，设备的增加和改善使医院的诊断治疗得到了很大的提高。C型臂在心血管内科先后开展了冠状动脉造影、PTCA支架植入、心律失常，射频消融术及周围血管造影术等；特检科的彩色B超、动态心电图、动态血压仪等新仪器为诊断治疗及病情动态变化的监测提供了可靠的保证；腹腔镜在外科、妇产科开展了一系列“微创”手术，前节激光治疗仪在眼科的治疗开展有了较大进展。
目前，喀什兵团农三师医院希望在普外科、妇产科、神经内科专业上得到技术支持，使这些专业的技术水平能够更上一个台阶，同时希望加强医院管理方面的交流。